| 序号 | 专业名称 | 专业说明 | 学制 (年) |
| 1 | 护理 | | 3 |
| 2 | 助产 | | 3 |
| 3 | 老年保健与管理 | | 3 |
| 4 | 药学 | | 3 |
| 5 | 口腔医学技术 | | 3 |
| 6 | 中医学 | | 3 |
| 7 | 中药学 | | 3 |
| 8 | 针灸推拿 | | 3 |
| 9 | 医学检验技术 | | 3 |
| 10 | 卫生信息管理 | | 3 |
| 11 | 医学影像技术 | | 3 |
| 12 | 放射治疗技术 | | 3 |
| 13 | 康复治疗技术 | | 3 |
| 14 | 中医康复技术 | | 3 |
| 15 | 康复辅助器具技术 | | 3 |
| 16 | 言语听觉康复技术 | 与南京特殊教育师范学院分段培养项目,在江苏医药职业学院学习五年,其中前三年高职阶段教育考核合格者,后两年本科阶段教育继续在高职院校内学习,由本科院校与高职院校联合实施教学,毕业后颁发分段培养院校本科文凭 | 3 |
| 17 | 护理 | | 3 |
| 18 | 助产 | | 3 |
| 19 | 老年保健与管理 | | 3 |
| 20 | 药学 | | 3 |
| 21 | 口腔医学技术 | | 3 |
| 22 | 中医学 | | 3 |
| 23 | 中药学 | | 3 |
| 24 | 针灸推拿 | | 3 |
| 25 | 医学检验技术 | | 3 |
| 26 | 卫生信息管理 | | 3 |
| 27 | 医学影像技术 | | 3 |
| 28 | 放射治疗技术 | | 3 |
| 29 | 康复治疗技术 | | 3 |
| 30 | 中医康复技术 | | 3 |
| 31 | 康复辅助器具技术 | | 3 |
| 32 | 药学 | 在江苏医药职业学院学习三年,考核合格者可转入徐州医科大学学习两年,毕业后颁发徐州医科大学本科文凭 | 3 |
| 33 | 医学影像技术 | 在江苏医药职业学院学习三年,考核合格者可转入徐州医科大学学习两年,毕业后颁发徐州医科大学本科文凭 | 3 |
| 34 | 中药学 | 在江苏医药职业学院学习五年,其中前三年高职阶段教育考核合格者,后两年本科阶段教育继续在高职院校内学斗,由本科院校与高职院校联合实施教学,毕业后颁发南京中医药大学本科文凭 | 3 |
| 35 | 康复治疗技术 | 在江苏医药职业学院学习五年,其中前三年高职阶段教育考核合格者,后两年本科阶段教育继续在高职院校内学斗,由本科院校与高职院校联合实施教学,毕业后颁发南京中医药大学本科文凭 | 3 |
| 36 | 言语听觉康复技术 | 在江苏医药职业学院学习五年,其中前三年高职阶段教育考核合格者,后两年本科阶段教育继续在高职院校内学习,由本科院校与高职院校联合实施教学,毕业后颁发南京特殊教育师范学院本科文凭 | 3 |
| 37 | 临床医学 | | 3 |
| 38 | 口腔医学 | | 3 |
| 39 | 预防医学 | | 3 |